مناهج حفظ القرآن لا تقتصر فقط على الحفظ والتلقين، بل يتعلم الطالب معاني المفردات والدروس المستفادة من السورة وما يرتبط بها من قصص وأحكام. ولها أربعة مستويات: التمهيدي المختص بقصار السور، والأول لجزء عم والثاني لجزء تبارك، والثالث لبقية القرآن الكريم، ويمكن للدارس أن يختار السورة التي يريد أن يحفظها دون التقيد بهذه المحطات الأربع، ولكن بشرط أن يكون مجيدا للقراءة من المصحف.